Primats de l'Egypte ancienne : la déification et l'importance des babouins et des singes - Première partie

Primats de l'Egypte ancienne : la déification et l'importance des babouins et des singes - Première partie


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Les anciens Égyptiens peuplaient leur vaste panthéon de dieux et de déesses d'une incroyable ménagerie d'animaux et d'oiseaux. Des créatures ordinaires aux créatures exotiques, pratiquement toutes les bêtes imaginables étaient vénérées par les masses. Les singes et les babouins étaient également très appréciés dans divers rôles et contextes tout au long de l'histoire égyptienne. En tant que représentants des dieux et dans leur rôle d'animaux de compagnie et d'aides, ces animaux étaient chers au peuple. Assez bizarrement, en plus d'être entraîné à cueillir des fruits et à prêter main-forte aux tâches banales ; les singes ont également formé une équipe d'élite qui était le pire cauchemar de tous les criminels ! Les preuves montrent que les primates surveillaient les rues avec leurs homologues humains – un peu comme les compagnons canins des flics aujourd'hui.

Une sculpture en stéatite d'un babouin assis représentant le dieu de la sagesse, Thot. Nouvel Empire. Musée d'art du comté de Los Angeles.

Saluer les babouins et les singes

Les Égyptiens étaient d'avis que les êtres vivants, grands et petits ; à plumes et à écailles, étaient les dépositaires de pouvoirs magiques. Dotées de capacités spéciales, ces créatures étaient censées communiquer avec les dieux et jouer le rôle d'intermédiaires entre la multitude de divinités et l'humanité. Cependant, même si les animaux étaient considérés comme des messagers sacrés, la population ne les vénérait pas en soi. Au contraire, ils ont rendu hommage aux attributs invisibles et surnaturels des divinités qu'ils croyaient manifestées sous forme animale. Et ainsi, une gamme de bêtes et d'oiseaux ont été annoncés dans des centres de culte dédiés à leur culte à travers le pays.

Les côtés de ce siège d'une statue de groupe sont décorés d'images de babouins. Sur le côté droit, vu ici, l'animal est représenté tenant un pot cosmétique ou un eye-liner khôl. Calcaire peint. XVIIIe dynastie. Musée égyptien, Le Caire.

L'avènement des babouins dans la religion remonte à l'aube de la civilisation égyptienne ; et l'une des premières divinités prédynastiques était le dieu babouin Baba (ou Babi) - "Taureau des babouins" qui, pensait-on, dévorait les entrailles des morts immoraux. Les exemples de représentations artistiques de singes et de babouins – qu'il s'agisse de sculptures, de reliefs ou de peintures – abondaient dans tout le pays. L'art existant des périodes de l'Ancien et du Nouvel Empire dépeint les primates dans différents contextes ; et les singes en particulier sont souvent représentés en train de participer à des activités humaines, notamment la récolte de figues, le jeu d'instruments de musique, la danse et même la police !

Ce n'est pas tout; des singes peuvent être vus dans les pressoirs, prêtant main-forte à la production de bière et également au gréement et à la construction de bateaux. "Cependant, des érudits tels que Deiter Kessler pensent qu'il n'y avait pas de singes dressés dans l'Égypte ancienne et que la plupart de ces scènes ont une sorte de" fonction religio-théologique ", bien qu'en particulier sur les ostraca du Nouvel Empire, il puisse également y avoir un élément d'humour », note l'érudit égyptologue Jimmy Dunn.

Ce relief du temple funéraire de Ramsès III montre le roi adorant aux côtés de babouins sacrés. Médinet Habou, Nécropole thébaine. (Photo: CC by SA 3.0 / Rémih )

Les Égyptiens considéraient les singes au-delà de leurs bouffonneries humoristiques ; ils les considéraient comme des symboles érotiques liés au cycle de la naissance, de la mort et de la renaissance. « Les singes étaient évidemment étroitement liés à la sexualité féminine, probablement à un niveau moins subtil que le canard ou l'oie. Le babouin qui, dans certains cas, alterne avec le singe, avait la valeur phonétique « nfr », mot qui ne peut pas toujours être traduit par un mot anglais équivalent. « Bon », « Beau » et ainsi de suite est le rendu conventionnel, mais le mot implique également quelque chose de dynamique, de créatif et de puissant », écrit le Dr Lise Manniche.

Malgré leur apparence effrayante et leur nature imprévisible, les babouins et les singes étaient élevés comme animaux de compagnie, ces derniers étant importés de Nubie. La reine thébaine Makare a été enterrée avec son singe vert femelle préféré. Cette espèce a été divinisée comme un aspect du dieu primitif invisible, Atoum, en particulier lorsqu'elle est représentée en train de tirer avec un arc et des flèches. Les preuves suggèrent également que ces primates étaient exclusivement élevés dans des temples, comme de nombreux autres animaux et oiseaux qui étaient associés à des divinités spécifiques et sacrés pour celles-ci.

Deux hommes sont représentés attrapant des oiseaux, tandis que dans le registre inférieur, un garçon est représenté jouant avec deux singes. Tombeau d'Atet, Meidoum. Calcaire avec incrustations. IVe dynastie. Glyptotek, Copenhague.

King's Connect avec les Hamadryas

Les experts estiment que contrairement aux babouins, les singes n'étaient pas vénérés en Égypte de leur vivant. L'animal a été déifié post mortem après sa momification, avant laquelle ils ont passé leur vie dans les sanctuaires des temples. L'inhumation rituelle des singes dans les grandes nécropoles qui leur sont dédiées ainsi que dans les sépultures des nobles et des rois était une pratique courante.

Les babouins représentés dans l'art étaient principalement les hamadryas (Papio hamadryas), une espèce de la famille des singes de l'Ancien Monde. Les babouins Hamadryas étaient associés à Thoth-Khonsu, le dieu de la lune à tête d'ibis qui était vénéré comme le dieu de la sagesse et crédité de la conception des hiéroglyphes. Thot fonctionnait également comme scribe des dieux et jouait un rôle majeur dans les rituels de l'au-delà. «Au temple de Khonsou à Thèbes, des statues de Khonsou sous la forme d'un babouin faisaient face au complexe. À la fin de la période, nous savons d'une tombe de babouin à Saqqarah que le dieu Thoth-Khonsou est devenu un dieu oracle nocturne important, auquel des pétitions écrites ont été soumises. Sous cette forme, pendant la période grecque, il s'appelait Metasythmis, ce qui signifie « « l'oreille qui entend »», révèle Jimmy Dunn.

Sculpture en quartzite d'un babouin hamadryas assis (vers 1400 av. J.-C.), représentant le dieu Thot. Musée anglais. (Photo: CC par SA 3.0 / Steven G. Johnson )

Astennu, le serviteur de Thot, était représenté comme un hamadryas en sa qualité d'enregistreur du résultat de la cérémonie cruciale de la Pesée du Cœur ; et comme l'un des quatre babouins hamadryas gardant le lac de feu à Duat ou dans le monde souterrain. « L'image du babouin Thoth à côté d'un œil wedjat apparaît sur des baguettes magiques dès le vingtième siècle avant JC. Deux formes de babouin du dieu Khons contrôlaient les livres de la fin de l'année. Celles-ci contenaient des listes de ceux qui étaient destinés à mourir et de ceux qui vivraient », explique l'égyptologue, le Dr Geraldine Pinch.

Le scribe Nebmeroutef est représenté sous le regard attentif du dieu Thot, patron de l'écriture. Il est absorbé par la lecture d'un document, assis en tailleur sur le sol, le torse légèrement penché en avant et la main droite posée sur le papyrus. Au-dessus de lui, le babouin sacré de Thot est assis sur un piédestal. Musée du Louvre, Paris.

Au cours de la cérémonie de renouvellement du monde physique et de la personne du souverain, les ancêtres individuels étaient rituellement divinisés sous la forme de babouins et recevaient des offrandes cultuelles. L'érection de kiosques en bois contenant des babouins ancestraux lors du festival Heb Sed du rajeunissement royal peut s'être développée à partir de cette pratique antérieure. Une image d'un babouin représentant le roi Narmer, érigé par un fonctionnaire, suggère implicitement la transformation du roi en babouin, dans le cadre d'une fête de rajeunissement. Il est intéressant de noter que le roi était identifié à un dieu babouin connu sous le nom de « Grand Blanc ». Certains érudits pensent que le titre de ce dieu est dérivé de la crinière gris argenté d'un hamadryas dominant.

Panneau en relief en pierre calcaire montrant deux babouins offrant l'œil wedjat au dieu soleil Khepri, qui tient le signe des Enfers. Période tardive – Période ptolémaïque. Musée métropolitain d'art , New York.

Essence de l'association divine

L'aspect le plus important des babouins, cependant, était leur association avec Ra, le puissant dieu du soleil. Dans cette optique, on trouve de nombreuses représentations de ces animaux adorant le soleil les bras levés, ou tenant un symbole solaire. Le babouin, sous son aspect de Hapy, l'un des quatre fils du dieu à tête de faucon Horus, était représenté sur des bouchons de jarres canopes car il était chargé de protéger les poumons du défunt. Hapy a également été dépeint dans la littérature funéraire comme protégeant le trône d'Osiris dans le monde souterrain.

Cette grande statue en quartzite de Thot en babouin a été érigée par le pharaon Amenhotep III. Hermopolis/El Ashmounein. (Photo: Tatiana Matveeva / flickr )

À partir du Nouvel Empire, les statues de temple de babouins sont plus abondantes. Ils semblent souvent s'accroupir sur une plate-forme surélevée, souvent accessible par un escalier. Des sculptures de babouin en quartzite géant du règne d'Amenhotep III ont été trouvées à Hermopolis, en Moyenne Egypte. L'âge des momies votives a commencé au cours de la vingt-sixième dynastie (ca. 664 av. J.-C.) et par les périodes tardive et gréco-romaine (332 av. ), les singes verts (Cercopithecus aethiops), les singes rouges (Cercopithecus pata) et le singe de barbarie (Macaca sylvanus).

[L'auteur remercie Merja Attia et Marguerite Patterson pour avoir accordé la permission d'utiliser leurs photographies dans cette série. Les archives publiques du Metropolitan Museum of Art sont accessibles ici.]

[Lire la partie 2 ]


Virusberriostechegaray

RLE DES VIRUS DANS L'ÉVOLUTION HUMAINE
ANNUAIRE D'ANTHROPOLOGIE PHYSIQUE 46:14 – 46 (2003)
© 2003 WILEY-LISS, INC.

Linda M. Van Blerkom
Département d'anthropologie, Drew University, Madison, New Jersey 07940
MOTS CLÉS maladies infectieuses hominidés paléoépidémiologie

L'étude de la génétique moléculaire virale a produit un corpus considérable de recherches sur les séquences et les relations phylogénétiques des virus humains et animaux. Une revue de cette littérature suggère que les humains ont été affectés par des virus tout au long de leur histoire évolutive, bien que le nombre et les types aient
modifié. Certains virus montrent des preuves de relations intimes de longue date et de cospéciation avec les hominidés, tandis que d'autres sont plus récemment acquis à partir d'autres espèces, y compris les singes et les grands singes africains alors que notre lignée évoluait dans
ce continent, et les animaux et les rongeurs domestiqués depuis le néolithique. La sélection virale pour des polymorphismes de résistance spécifiques est peu probable, mais en conjonction avec d'autres parasites, les virus ont probablement contribué à la pression de sélection
le maintien de la diversité du complexe majeur d'histocompatibilité (CMH) et d'une forte réponse immunitaire. Ils peuvent également avoir joué un rôle dans la perte dans notre lignée de l'acide N-glycolylneuraminique (Neu5Gc), un récepteur de surface cellulaire pour de nombreux agents infectieux. Des virus partagés pourraient avoir affecté la diversité des espèces d'hominidés à la fois en favorisant la divergence et en éliminant les populations hôtes moins résistantes, tandis que les virus transportés par les humains et d'autres animaux migrant hors d'Afrique peuvent avoir contribué au déclin d'autres populations. Les insertions rétrovirales endogènes depuis la divergence entre les humains et les chimpanzés étaient capables d'affecter directement l'évolution des hominidés par des changements dans l'expression et le développement des gènes. Yrbk Phys Anthropol
46:14 – 46, 2003. © 2003 Wiley-Liss, Dans

Glossaire
Stratégie de vie aiguë : stratégie (similaire à la sélection r) dans laquelle un virus augmente la forme physique en augmentant son taux de reproduction (progéniture produite par parent
génération). Souvent associée à une maladie, elle est caractéristique des virus avec des taux de mutation élevés et la capacité d'infecter plusieurs espèces hôtes. La transmission virale a tendance à être horizontale et dépend davantage de la structure et de la densité de la population hôte que pour les virus utilisant une stratégie de vie persistante (Villarreal et al., 2000).
Compétition apparente : Processus par lequel le partage d'un ennemi commun (un prédateur ou un agent pathogène) peut entraîner des conséquences similaires à celles des formes plus conventionnelles de compétition interspécifique pour limiter les ressources (Holt et Lawton, 1994).
Coévolution : changement évolutif réciproque des espèces en interaction (par exemple, hôte/parasite, prédateur/proie, plante/herbivore ou mutualisme), avec des changements dans la
deux espèces causées par une pression sélective mutuelle.
Cospéciation : spéciation parallèle de deux organismes avec une association écologique étroite (par exemple, hôte et parasite), de sorte que les cladogrammes des deux soient congrus.
Rétrovirus endogènes : séquences d'ADN, apparentées à celles des rétrovirus infectieux, qui sont intégrées dans les génomes de l'hôte et ont perdu la capacité de provoquer une infection active que l'on pense être des vestiges d'infections des cellules germinales anciennes, elles ont proliféré et évolué par rétrotransposition.
Seuil d'erreur-catastrophe : Le niveau de fidélité de copie critique en dessous duquel (c'est-à-dire le taux de substitution de base au-dessus duquel) l'information génétique virale peut
ne soient plus maintenus et les séquences nucléotidiques
deviendrait essentiellement aléatoire (Domingo et Holland, 1994).
Capture de gène : Acquisition de novo de gène par recombinaison d'un génome viral avec celui de l'hôte ou d'un autre virus.
Évolution liée à l'hôte : une forme de cospéciation, dans laquelle des virus bien adaptés vivant dans des hôtes uniques, grâce à une association ancienne avec eux, ont divergé et se sont spéciés avec leurs hôtes. L'isolement des populations virales et la pression de sélection exercée par l'hôte sont des facteurs importants dans ce processus, qui se traduit par une corrélation entre les phylogénies du virus et de l'hôte (Chan et al., 1997).
Hypermaladie : maladie extrêmement mortelle introduite dans une région par une espèce porteuse qui en est relativement peu affectée en même temps, elle est capable
d'infecter une variété d'autres espèces avec des taux de mortalité élevés et a le potentiel de provoquer leur extinction (MacPhee et Marx, 1997).
Évolution modulaire : acquisition de nouveaux gènes actifs par recombinaison de séquences d'acides nucléiques spécifiques ou de domaines fonctionnels au sein de gènes communs aux virus
évolution, avec recombinaison se produisant à la fois entre et au sein des taxons viraux.
Compétition à médiation parasitaire : une forme de compétition apparente, par laquelle le partage d'un agent pathogène par deux espèces peut entraîner le déclin de la population, voire l'extinction, de l'un des hôtes, même en l'absence de compétition pour les ressources (Holt et Pickering, 1985) .

Stratégie de vie persistante : Une stratégie dans laquelle un virus augmente la forme physique en augmentant le temps de survie de sa progéniture, augmentant ainsi la persistance chez un hôte individuel et la probabilité de transmission au fil du temps. Caractéristique des virus génétiquement stables qui présentent une cospéciation avec leurs hôtes, cette stratégie est souvent associée à une transmission verticale ou sexuelle. Infection latente, avec la capacité du
virus à réactiver, est un résultat fréquent (Villarreal et al., 2000).

Quasi-espèce : Une population virale de variantes génétiques étroitement apparentées mais distinctes résultant d'un processus de réplication sujet aux erreurs (typique des virus à ARN, dans
en particulier) une population autonome de séquences qui se reproduisent imparfaitement mais suffisamment bien pour conserver une identité collective au fil du temps, mais qui contiennent également le potentiel de produire des souches plus virulentes (Eigen, 1993).

Zoonose : Une infection ou une maladie infectieuse transmissible dans des conditions naturelles d'autres animaux vertébrés à l'homme. La plupart des zoonoses sont des infections sans issue avec peu ou pas de transmission entre les hôtes humains.

L'étude de l'évolution humaine s'est concentrée sur les humains et leurs ancêtres hominidés 1, sans porter autant d'attention aux autres organismes évoluant également dans les mêmes environnements. Mais une population doit constamment interagir et s'adapter à ces autres organismes si elle veut survivre et se reproduire. Les espèces alimentaires, les prédateurs et les agents de maladies infectieuses ont tous joué un rôle dans l'évolution humaine, et parmi ces derniers, les virus étaient probablement particulièrement importants.

En tant que causes importantes de morbidité et de mortalité, et dans leur capacité à agir comme des « parasites génétiques moléculaires » (Luria, 1959), les virus sont en position de force
d'inuencer l'évolution de leurs hôtes (May, 1995 Villarreal, 1999 Balter, 2000). Bien que cela soit bien reconnu dans les études sur l'évolution d'autres organismes (en particulier les plantes, par exemple, Thompson et Burdon, 1992 Simms, 1996), l'impact des maladies infectieuses sur l'évolution humaine n'a pas reçu l'attention qu'il mérite (Swedlund, 2000). Pourtant, les parasites viraux ont probablement joué un rôle important dans l'évolution humaine (de Souza Leal et Zanotto, 2000). Le but de cet article est de passer en revue les travaux récents sur la génétique moléculaire des virus humains et d'évaluer dans quelle mesure les virus étaient des parasites importants d'hominidés antérieurs (et donc en mesure d'avoir affecté l'évolution humaine avant le néolithique). Il spécule également sur les rôles qu'ils ont pu jouer.

Haldane (1949) a été parmi les premiers à suggérer que la lutte contre les maladies infectieuses était un processus évolutif important, et il a décrit certains effets possibles. Une maladie qui tue ou diminue la fertilité est probablement un agent sélectif. Elle peut être un avantage ou un inconvénient pour une espèce en compétition avec d'autres, voire contribuer à son extinction.

La plupart des espèces contiennent une diversité génétique considérable dans leur résistance contre les maladies, et compte tenu de la vitesse à laquelle les nouveaux agents pathogènes évoluent (en général beaucoup plus vite que l'hôte), il est dans le meilleur intérêt de l'hôte d'être génétiquement diversifié et hautement mutable dans les loci. concernés par la résistance aux maladies. Selon Haldane (1949), la maladie peut même favoriser la spéciation, en couplant cette diversité
et mutabilité avec isolement géographique. De plus, les exigences de transmission peuvent avoir contribué à la taille et à la structure de la population hôte et à des caractéristiques comportementales telles que la réaction négative aux odeurs fécales.

Au fur et à mesure que la communauté scientifique prenait conscience de la « diversité biochimique surprenante » (Haldane, 1949, p. 329) chez pratiquement tous les animaux étudiés, les généticiens ont cherché à l'expliquer. Les estimations de la proportion de loci polymorphes allaient de 20 à 40 % en
vertébrés et environ 30 % chez l'homme (Selander et al., 1970). Certains ont suggéré que les interactions entre les parasites et les hôtes jouaient un rôle important dans le maintien de ce degré de polymorphisme (Clarke, 1976). Hamilton et al. (1990) ont suggéré que le
Le besoin de diversité génétique dans une « course aux armements hôte-pathogène » a même contribué à l'évolution de la reproduction sexuée. Nous savons maintenant que ce niveau de polymorphisme (30%) est probablement une sous-estimation, basée sur un échantillonnage incomplet de mutations rares.
Compte tenu de la fréquence du polymorphisme de l'ADN (environ un nucléotide sur 500), presque tous les gènes peuvent être polymorphes (Cavalli-Sforza et al., 1994). On estime maintenant que le génome humain contient entre deux et trois millions de polymorphismes mononucléotidiques (SNP), et même si moins de 1% sont estimés entraîner une variation des protéines, cela laisse encore assez pour impliquer beaucoup plus de 30% des estimé à 20 000 𔃁 000 gènes humains (International Human Genome Sequencing Consortium, 2003 Venter et al., 2003).

La pression sélective induite par la maladie est maintenant considérée comme une raison probable du degré étonnant de polymorphisme dans le complexe majeur d'histocompatibilité (CMH), qui code pour les glycoprotéines membranaires [également appelées antigènes leucocytaires humains
(HLA) chez l'homme] qui jouent un rôle important dans le système immunitaire en liant des fragments d'origine infectieuse et en les présentant aux cellules T (Zinkernagel et al., 1985 Howard, 1991). L'importance du maintien de cette première ligne de défense contre les agents pathogènes envahissants est soulignée par la découverte que certains allèles polymorphes du système MHC sont antérieurs à la divergence entre les chimpanzés et les humains et ont été transmis à travers des goulots d'étranglement de spéciation via la « sélection trans-espèces » ( Takahata, 1990).

Cet article utilise la nomenclature taxonomique traditionnelle, par laquelle le terme « hominide » fait référence aux humains et à leurs parents bipèdes, tandis que les singes et les humains sont inclus dans les hominoïdes.

RLE DES VIRUS DANS L'ÉVOLUTION HUMAINE 15 TABLEAU 1. Familles de virus animaux
Famille Description Évolution
Adenoviridae Virus à ADN de taille moyenne qui provoquent des infections respiratoires et entériques
infections chez les oiseaux et les mammifères de nombreux sous-types chez l'homme et d'autres primates.
Évolués avec les sous-types d'animaux à sang chaud ont divergé au cours de l'évolution de
primates (Song et al., 1996).
Les virus à ARN Arenaviridae, principalement zoonotiques et maintenus dans des réservoirs de rongeurs, se propagent par contact avec des sécrétions de rongeurs infectés, par exemple, fièvre de Lassa et lymphocytaire
virus de la chorioméningite. Coévolution à long terme avec les rongeurs hôtes, les hominidés ne les ayant probablement pas rencontrés avant l'agriculture et les maisons permanentes (Bowen et al., 1997).
Astroviridae Virus à ARN répandus dans le monde entier chez l'homme et d'autres animaux, d'origine hydrique et alimentaire, cause importante de maladies diarrhéiques dans les pays en développement.
On ne sait pas encore grand-chose à ce sujet.
Bunyaviridae Parmi les plus gros virus à ARN, ceux-ci sont zoonotiques et émergents principalement transmis par les arthropodes (par exemple, la fièvre de la Vallée du Rift, l'encéphalite californienne, la fièvre hémorragique de Crimée-Congo), à l'exception de l'hantavirus. Originaire d'insectes et co-évolué avec
la phylogénie des hantavirus montre une coévolution avec les rongeurs et un changement d'hôte (Zhao et Hay, 1997 Vapalahti et al., 1999).
Caliciviridae Virus à ARN répandus dans le monde entier chez l'homme et d'autres vertébrés, cause fréquente de diarrhée chez les enfants transmise par l'intermédiaire d'aliments et d'eau contaminés ou de coquillages non cuits. Les séquences montrent des similitudes géographiques qui transcendent les relations avec l'hôte et se déplacent facilement à travers les barrières d'espèces qui vont et viennent entre les humains et les animaux domestiques (van der Poel et al., 2000).
Coronaviridae Les plus gros virus à ARN, infectant les humains, les bovins, les porcs, les rongeurs, les chats, les chiens et les poulets, cause fréquente de rhume chez l'homme et de diverses affections chez d'autres animaux, principalement des particules entériques et respiratoires de type CV trouvées dans les selles de chimpanzés adultes, macaques, babouins et ouistitis. Dérive antigénique et recombinaison
produire constamment de nouvelles souches, la propagation interspécifique conduit à une évolution épisodique (Lai, 1995).
Les virus à ARN Filoviridae qui infectent uniquement les vertébrés contiennent deux espèces (Ebola et Marburg) qui provoquent une maladie mortelle aiguë chez l'homme et d'autres primates réservoirs inconnus. On estime que deux espèces ont divergé de 7–82118 kya, et les sous-types d'Ebola se sont diversifiés de 1–82112 kya (Suzuki et Gojobori, 1997).
Flaviviridae virus à ARN, y compris de nombreux arbovirus (p. ex., fièvre jaune, dengue, West Nile, encéphalite à tiques), diarrhée bovine, peste porcine et virus de type hépatite C (VHC, GBV-A, -B et -C) GB-virus largement répandus chez les simiens.
Les virus transmis par les moustiques, originaires d'Afrique, affectent les primates depuis longtemps. Présence à long terme du VHC également en Afrique, mais n'infecte que les humains
Hepadnaviridae Les virus de l'hépatite B trouvés chez les primates, les rongeurs du Nouveau Monde et les oiseaux parmi les plus petits virus contiennent un ADN circulaire partiellement double brin répliqué via un ARN intermédiaire et une transcriptase inverse. Peut avoir cospécié avec des primates
les souches humaines résultent d'une ancienne transmission interspécifique en Afrique maintenant
trouvé dans des populations humaines isolées dans les deux hémisphères (Simmonds, 2001).
Herpesviridae Gros virus à ADN, la plupart des espèces de vertébrés en possèdent au moins un.
Trois sous-familles alpha- (herpès simplex, varicelle), bêta-(cytomégalovirus) et gammaherpesvirinae (Epstein-Barr, sarcome de Kaposi). Tous contiennent de nombreuses souches trouvées chez d'autres animaux, y compris les primates.
Ancienne divergence de sous-familles avec une spécificité tissulaire acquise tôt, au moins 200 millions d'années ont depuis coévolué en étroite association avec les hôtes (McGeoch et al., 2000 McGeoch, 2001).
Orthomyxoviridae Les virus à ARN de sous-types A, B et C de la grippe avec des génomes segmentés qui se réassortissent facilement, produisant des souches de grippe pandémique A sauvage A, maintenues chez des hôtes aviaires, infectent également les porcs, les chevaux et d'autres sous-types de mammifères B et C infectent uniquement les humains. Le sous-type A semble être un ancien parasite des oiseaux aquatiques. Les souches de virus aviaires sont en évolution récente et explosive chez les porcs et les humains (Webster, 1997).
Papovaviridae Les virus répandus et nombreux avec un très petit ADN circulaire comprennent les papillomavirus qui provoquent des lésions cutanées ou génitales (p. les espèces d'oiseaux et de reptiles étudiées jusqu'à présent portent des PV spécifiques à l'espèce, la plupart infectés par plusieurs types de VPH et de JC trouvés dans presque toutes les populations humaines.
La diversité des espèces et des types de papillomes suggère qu'un parasite bien adapté, intimement associé aux hôtes depuis longtemps et cospéciant avec eux également coévolué avec l'homme, peut être utilisé pour retracer les migrations (Ong et al., 1993 Van Ranst et al., 1995). JC est un agent pathogène humain omniprésent dont les génotypes ont divergé lorsque les populations humaines ont divergé (Hatwell et Sharp, 2000).
Les virus à ARN Paramyxoviridae qui incluent la parainfluenza, les oreillons, les morbillivirus (par exemple, la rougeole, la maladie de Carré, la peste bovine) et de nombreux autres virus humains et autres animaux comprennent les virus émergents Nipah et Hendra transmis principalement par des gouttelettes aéroportées. La phylogénie des morbillivirus animaux correspond à celle des espèces hôtes, mais les virus humains résultent probablement d'une transmission interspécifique récente à partir d'animaux domestiques (Norrby et al., 1992). 16 L.M. VAN BLERKOM
Alors qu'une telle sélection positive est toujours censée avoir maintenu de nombreuses lignées alléliques du CMH, le partage des polymorphismes du CMH par différents ordres de mammifères et même certains au sein des primates (par exemple, entre les humains et les singes du Nouveau Monde) peut être le
résultat d'une évolution convergente (Yeager et Hughes, 1999 Kriener et al., 2000).
Les zoologistes reconnaissent maintenant que les maladies infectieuses peuvent favoriser la « compétition apparente » entre les espèces et augmenter le danger d'extinction (Hudson et Greenman, 1998 Daszak et al., 2000).
Certains ont même suggéré un scénario d'«hypermaladie», impliquant des infections véhiculées par des humains en migration ou leurs chiens, pour expliquer les extinctions de la mégafaune du Pléistocène (MacPhee et Marx, 1997).
Une autre manière dont les agents pathogènes peuvent affecter l'évolution de leurs hôtes est l'interaction directe avec l'ADN de l'hôte. En raison de leur simplicité et
leur besoin d'utiliser des machines de réplication et de transcription de la cellule hôte, les virus agissent comme des « parasites génétiques moléculaires » (Luria, 1959) et peuvent altérer les génomes de l'hôte par des mécanismes tels que la recombinaison, la rétrotransposition et la conversion génique. Tout en durable
les effets sont plus fréquents chez les hôtes unicellulaires et les plantes, les anciennes infections des cellules germinales par les rétrovirus ont laissé leur marque sur les génomes humains et autres primates (Sverdlov, 2000).
TABLEAU 1. (Suite)
Famille Description Évolution
Parvoviridae Parmi les virus les plus petits et les plus simples connus, à simple brin
Les génomes à ADN répandus chez de nombreux hôtes vertébrés et invertébrés ont tendance à infecter les tissus à division rapide (principalement le fœtus, l'épithélium intestinal et la moelle osseuse).
Evolution virale très spécifique à l'espèce étroitement liée à celle de l'hôte (Shadan et Villarreal, 1993), mais peu connue des parvovirus humains.
Picornaviridae Plusieurs genres de virus à ARN : Aphtovirus (fièvre aphteuse), Cardiovirus (encéphalomyocardite), Enterovirus (Coxsackie, echo, polio), Hepatovirus (hépatite A), Parechovirus et Rhinovirus (rhume) les quatre derniers genres infectent
principalement des humains, avec des virus d'animaux domestiqués probablement dérivés de souches humaines.
Divers et nombreux virus simiens proviennent tous de primates de l'Ancien Monde et sont les plus proches parents connus des entérovirus humains, certains picornavirus peuvent avoir été longtemps associés aux humains (Gromeier et al., 1999).
La sous-famille des vertébrés connus du génome de l'ADN des Poxviridae comprend un grand nombre de poxvirus infectant de nombreux animaux (par exemple, la variole, la vaccine, la variole, la variole du singe, la variole du chameau, la variole aviaire, la variole ovine et caprine, la variole porcine) ainsi que le virus du molluscum contagiosum de l'homme. Beaucoup (par exemple, cowpox, monkeypox) sont maintenus chez les rongeurs
réservoirs.
Les origines de la variole (variole) peu claires peuvent être un ancien virus hominidé (comme le molluscum contagiosum) qui est récemment devenu plus virulent, ou peut-être plus récemment évolué à partir du virus des rongeurs africains (Fenner et al., 1988 Tucker, 2001).
Reoviridae “Respiratory enteric orphelin” virus, avec des génomes à ARN double brin omniprésents dans la nature, impliquant un tropisme cellulaire large, des récepteurs ubiquitaires infectent les vertébrés (mammifères, oiseaux, reptiles, poissons), les invertébrés (insectes, mollusques) et
les plantes trouvées chez tous les mammifères à l'exception des baleines les variétés humaines comprennent les rotavirus, cause fréquente de diarrhée sévère dans le monde, principale cause de mortalité chez les jeunes de
de nombreuses espèces comprennent de nombreux virus émergents qui provoquent la fièvre hémorragique, l'encéphalite, la fièvre à tiques du Colorado. Les membres à évolution rapide de divers genres parmi les virus à ARN les plus divergents sur le plan de l'évolution (Duncan, 1999) la transmission fréquente entre les espèces et le réassortiment du génome segmenté donnent différents arbres pour différents gènes et une relation étroite entre les rotavirus humains et non humains (Cunliffe et al.,
1997).
Les virus à ARN des Retroviridae qui se reproduisent à l'aide de la transcriptase inverse et d'un sous-groupe intermédiaire d'ADN comprennent les lentivirus (p.
vertébrés, et peuvent sauter des espèces hôtes, parfois sur de grandes distances phylogénétiques
Rétrovirus de la grande antiquité et éléments rétroïdes trouvés chez tous les eucaryotes
rétrovirus infectieux trouvés uniquement chez les vertébrés et peuvent avoir évolué à partir de
taux de mutation extrêmement rapides des rétrotransposons, mais peut aussi être très
stable (par exemple, en tant que provirus intégré) certains SIV présentent des signes de cospéciation
avec des hôtes, tandis que d'autres sont le résultat d'une transmission interspécifique récente (VIH-1
de SIVcpz et HIV-2 de SIVsm) HTLV-I et -II de même de STLV de macaques asiatiques et de bonobos, respectivement (Holmes, 2001 Salemi et al., 2000).
Rhabdoviridae virus à ARN qui incluent le genre Lyssavirus (rage) et le virus de la stomatite vésiculeuse, il n'y a pas de rhabdovirus spécifiquement humains, mais la rage est l'une des zoonoses les plus dangereuses. La famille très ancienne contient des membres qui infectent les animaux et d'autres qui infectent les plantes. La rage semble dérivée des lyssavirus des chauves-souris africaines (Amengual et al., 1997).
Virus à ARN Togaviridae, principalement transmis par les moustiques et du genre Alphavirus, y compris un certain nombre de virus zoonotiques maintenus dans des réservoirs de rongeurs et d'oiseaux (par exemple, encéphalite équine de l'Est et de l'Ouest, virus de la forêt Semliki) également du genre Rubivirus
(rubéole), qui n'est pas à transmission vectorielle et n'infecte que les humains. Évolués dans les insectes contiennent des segments de virus végétaux via la recombinaison dans les insectes
hôtes (Lai, 1995). Origine de la rubéole inconnue.

Before one can judge the likelihood of any of these processes contributing to human evolution, one must determine whether our hominid ancestors suffered significantly from infections, whether they could have been significant causes of morbidity or
mortality (and thus agents of selection), and what kinds of parasites may have been involved.
The study of human disease history has tended to assume an epidemic disease model and a focus on human ecology and population history, with most infectious diseases considered to have evolved since the increased size and concentration of human populations in the Neolithic (Cockburn, 1967b Burnet and White, 1972 Armelagos and Dewey, 1978). The impact of parasitism before that time was not considered very important, as it appeared to be restricted to chronic latent infections unlikely to cause serious disease and the occasional zoonosis (disease of another animal species). Meanwhile, the influence of disease on human affairs since the Neolithic was
acknowledged to have been considerable (McNeill, 1976). Humans were assumed to have had few viral diseases before the Neolithic (Burnet and White, 1972), but studies of antibodies in isolated South American tribes suggested that small isolated groups had their share of infections (Neel et al., 1964, 1968 Black, 1975), and Cockburn (1967a) recognized the presence of many viruses in wild primates and thus, probably, in our ancestors. Perhaps infectious agents, and viruses in particular, were
more important than we thought.
Recent advances in molecular virology have provided a gold mine of information about the evolutionary history of the most important human viruses, and this allows one to decipher when they might have entered our line (Zimmer, 2001). Deep phylogenetic branches, high genetic diversity, global distributions, and trees showing cospeciation with primate hosts all suggest ancient association of many viruses with humans, while close relationships with viruses infecting other species (especially
rodents and domesticates) suggest more recent acquisition of others. The ease with which our species acquires emerging infections from other primates points to the importance of these zoonoses as a source of human disease, both now and in the past.
When mapping the evolutionary relationships of human and animal viruses, one obtains a different picture depending on whether the viruses in question are DNA-based, RNA-based, or replicated using reverse transcriptase, so these types are discussed
separately.